Sakson sprawował swoją funkcję od 2004 roku. Ostatnio pojawiały się informacje o narastającym konflikcie z częścią zespołu. MSZ zapowiada, że bliskim czasie zostaną podjęte decyzje, które umożliwią sprawne i owocne działanie Instytutu Zachodniego w Poznaniu pod nowym kierownictwem. Andrzej Sakson poinformował nas, że zamierza pozostać w tej placówce badawczej jako zwykły pracownik. Jego zdaniem do rozstrzygnięcia konkursu, obowiązki dyrektora przejmie jego zastępca.