Kapłańską drogę rozpoczynał w 1963 roku w wielkopolskim Śmiglu. W 1972 roku został notariuszem w poznańskiej kurii. W 1982 roku papież Jan Paweł II mianował go biskupem pomocniczym w Poznaniu.
W 2014 roku papież Franciszek przyjął rezygnację Zdzisława Fortuniaka z pełnienia posługi biskupa pomocniczego archidiecezji poznańskiej. Nadal jednak przysługuje mu tytuł biskupa-seniora.
Jego jubileusz, połączony z 60-leciem kapłaństwa kilku innych duchownych, o 11:00 w kościele NMP in Summo na Ostrowie Tumskim w Poznaniu.