Centrum zostało otwarte we wrześniu 2021 roku. Walczył o to wieloletni dziennikarz Radia Merkury Szymon Mazur. Centrum prezentuje nie tylko historię złamania szyfru Enigmy przez polskich kryptologów Mariana Rejewskiego, Henryka Zygalskiego i Jerzego Różyckiego, ale również ich wkład w rozwój świata cyfrowego.
Obiekt został otwarty w dawnym Collegium Historicum. W budynku przed laty siedzibę miał Komitet Wojewódzki Polskiej Zjednoczonej Partii Robotniczej.
Centrum Szyfrów Enigma informuje, że student, który był stutysięcznym odwiedzającym, spędził na ekspozycji kilka godzin.